知网查重留下痕迹的主要原因在于其查重算法会识别出文章中与知网数据库相似的内容，导致文章被认定为抄袭。为避免此情况，可以采取一些措施，如增加原创内容比例、避免直接复制粘贴等。此外，可以尝试对文章进行适当的改写，以减少与知网数据库的相似度，从而降低查重留下痕迹的可能性。

另外，还可以通过使用专业的反查重工具，对文章进行反复核对和调整，确保文章的原创性和独特性。同时，及时了解知网查重系统的更新和优化情况，以便针对性地调整文章内容，减少被查重留下痕迹的风险。综上所述，要避免知网查重留下痕迹，关键在于提高文章的原创性，采取有效的反查重措施，以确保文章通过查重检测并获得良好的评价。